Temas 16-18
Ácidos nucleicos y Síntesis de proteínas

test (verdadero/falso)

preguntas cortas

Test (verdadero/falso)

16-18.01 Esta secuencia de bases ACGGGACUUAGC pertenece a una molécula de DNA y no de RNA.

16-18.02 Para poder actuar, la DNA polimerasa necesita únicamente una monofibra de DNA patrón.

16-18.03 Para poder actuar, la RNA polimerasa necesita únicamente un molde de DNA y los ribonucleósidos trifosfato correspondientes.

16-18.04 La DNA polimerasa es capaz de llenar completamente los huecos entre fragmentos de Okazaki sin necesidad de ninguna actividad enzimática adicional.

16-18.05 Durante la replicación es esencial que cada una de las cadenas de DNA actúe de molde para la síntesis de la nueva cadena complementaria.

16-18.06 Durante la replicación se sintetizan pequeñas cadenas de RNA llamadas “primer" o cebadoras porque las DNA polimerasas necesitan una cadena preexistente con un extremo 3'-OH libre.

16-18.07 La única función biológica de los ribonucleótidos es formar parte del RNA.

16-18.08 A diferencia de las moléculas de DNA, las moléculas de RNA son monocatenarias y, por tanto, no forman estructuras secundarias ni terciarias.

16-18.09 Las moléculas de RNA se clasifican en diferentes tipos según su función biológica.

16-18.10 Los ribosomas son complejos formados por proteínas y RNA ribosómicos, y en ellos tiene lugar la traducción.

16-18.11 Las moléculas de mRNA actúan como un molde en la síntesis proteica.

16-18.12 El mRNA heterogéneo nuclear se utiliza de forma directa en la síntesis de proteínas.

16-18.13 En las células eucariotas, el proceso de síntesis de proteínas a partir del DNA se encuentra compartimentado.

16-18.14 En los eucariotas toda secuencia de un gen es codificante para proteínas.

Respuestas

Preguntas cortas

16-18.01- Al separar las hebras del DNA para proceder a su replicación, ¿qué problema topológico ocurre?

16-18.02- ¿Cuáles son los sustratos para la síntesis del DNA?

16-18.03- Comenta el mecanismo por el cual la DNA polimerasa III de E.coli consigue una elevada fidelidad en la replicación del DNA.

16-18.04- ¿Cuáles son los papeles de las actividades 5'-exonucleasa y 3'-exonucleasa de la DNA polimerasa I? ¿Cuál sería el fenotipo de una cepa de E.coli que careciera de la actividad 3'-exonucleasa?

16-18.05- Asumiendo que la replicación del DNA tiene lugar a una velocidad de 750 pares de bases por segundo, calcula cuánto tiempo llevará la replicación entera del genoma de E.coli (4.72·106 pb). Bajo condiciones óptimas, E.coli se divide cada 20 minutos. ¿Cuál es el número mínimo de horquillas de replicación que debe haber en un cromosoma de E.coli para mantener esta tasa de división celular? Si se estima que hay unas 10 moléculas de DNA polimerasa III en cada célula de E.coli, ¿es probable que la tasa de crecimiento de E.coli se vea limitada por los niveles de la DNA polimerasa III?

16-18.06- ¿Cuántos fragmentos de Okazaki se sintetizan, aproximadamente, en el transcurso de la replicación de un cromosoma de E.coli?

16-18.07- La recombinación homóloga en E.coli lleva a la formación de regiones de DNA heterodúplex, que contienen bases desapareadas. ¿Por qué no eliminan estos desapareamientos los sistemas de reparación de E.coli?

16-18.08- Responde brevemente: ¿en qué se diferencian la síntesis de RNA de la de DNA?

16-18.09- Describe el proceso de iniciación de la transcripción de un gen en E.coli.

16-18.10- Describe dos métodos por los que se puede terminar la transcripción de un gen de E.coli.

16-18.11- Haz un esquema del mecanismo del splicing. ¿Qué posible significado biológico puede tener la existencia de los intrones?

16-18.12- Los RNA mensajeros son sintetizados por RNA polimerasas que leen una cadena molde de DNA en sentido 3' 5', polimerizando los ribonucleótidos en sentido 5' 3'. Escribe la secuencia (5' 3') de la cadena molde de DNA a partir de la cual se transcribe el siguiente mRNA: 5'-UAGUGACAGUUGCGAU-3'.

16-18.13- El extremo 5' de un mRNA tiene la secuencia:
...AGAUCCGUAUGGCGAUCUCGACGAAGACUCCUAGGGAAUCC...

¿Cuál es la secuencia de la cadena con sentido del DNA del cual se ha transcrito este mRNA? Si este mRNA se traduce a partir del primer codón AUG, ¿cuál será la secuencia de aminoácidos del extremo N-terminal de la proteína codificada por él?

16-18.14- La RNA polimerasa tiene dos centros de unión para los ribonucleósidos trifosfato, el centro de iniciación y el centro de elongación. El centro de iniciación tiene una KM para los NTPs mayor que el centro de elongación. ¿Qué posible significado puede tener este hecho sobre el control de la transcripción?

16-18.15- ¿En qué difiere la transcripción en los eucariotas de la transcripción en los procariotas?

16-18.16- Las proteínas de unión al DNA reconocen regiones específicas del DNA, ya sea por lectura directa de la secuencia de bases como por "reconocimiento indirecto". ¿En qué difieren estos dos sistemas de reconocimiento DNA:proteína?

16-18.17- En los libros, cuando se muestra un tRNA apareado con su codón correspondiente, se representa al revés que cuando se muestra solo. ¿Por qué se hace así?

16-18.18- ¿En qué puntos de la síntesis de proteína intervienen los mecanismos que aseguran la fidelidad de la información?

16-18.19- Explica el papel de los chaperones en la síntesis de proteínas.

16-18.20- La siguiente secuencia representa parte de la secuencia de nucleótidos de un cDNA recientemente clonado:
...CAATACGAAGCAATCCCGCGACTAGACCTTAAC...
¿Puedes llegar a alguna conclusión sobre la secuencia parcial de aminoácidos de la proteína codificada por este mRNA, sin ninguna ambigüedad?

16-18.21- Se sintetizó un copolímero (AG) al azar, usando una mezcla de 5 partes de ATP y 1 parte de GTP como sustratos. Si este copolímero se traduce en un sistema libre de células, ¿qué aminoácidos se incorporarán al polipéptido? ¿Cuál será la proporción relativa de cada aminoácido?

16-18.22- Señala por qué la hipótesis del balanceo de Crick permite que los 61 codones con sentido puedan ser traducidos por menos de 61 anticodones. ¿Cómo permite acelerar la tasa de traducción el balanceo?

16-18.23- ¿Cuántos codones pueden mutar a codones sin sentido mediante cambios de una sola base? ¿Qué aminoácidos codifican?

16-18.24- Las supresiones sin sentido ocurren cuando aparece un mutante supresor que "lee" un codón de paro e inserta un aminoácido en su lugar correspondiente. ¿Qué aminoácidos crees tú que serán incorporados con más probabilidad por los mutantes supresores sin sentido?
¿Por qué crees que la velocidad de síntesis de proteínas en los eucariotas es sólo el 10% de la de los procariotas?
¿Por qué crees que los ribosomas existen invariablemente como estructuras de dos subunidades, en vez de constituir entidades más grandes, pero de una sola subunidad?

16-18.25- ¿Cómo determinan las células procariotas si un metionil-tRNAMet está destinado a iniciar la síntesis de una proteína o a incorporar un residuo Met en el interior de una cadena polipeptídica? ¿En qué difieren los codones Met para estos dos propósitos? ¿Cómo se las arreglan los eucariotas en estos casos?

16-18.26- ¿Qué es la secuencia de Shine-Dalgarno? ¿Cuál es su papel? La eficiencia de iniciación de la síntesis de proteínas puede variar hasta por un factor de 100 para los diferentes mRNA. ¿Cómo puede ser responsable de esta diferencia la secuencia de Shine-Dalgarno?

16-18.27- La rodanasa humana (33 kDa) consiste en una única cadena peptídica de 296 residuos. ¿Cuántos equivalentes de ATP se consumen, aproximadamente, en la síntesis de la cadena de la rodanasa a partir de los aminoácidos individuales y el plegamiento de la cadena hasta alcanzar su estructura terciaria activa? (NOTA: el plegamiento de la rodanasa, que requiere la participación de dos chaperones diferentes, consume unos 130 equivalentes de ATP.)

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