Influència de la infecció per Helicobacter pylori en la microbiota gàstrica

Abstract

El present treball combina una revisió exhaustiva amb un estudi experimental per conèixer com la infecció per Helicobacter pylori pot remodelar la microbiota gàstrica. L’objectiu principal és descriure aquesta modulació i posar èmfasi en les conseqüències d’aquesta. De manera complementària es caracteritza també la microbiota de pacients sans i es posen a punt metodologies moleculars aplicables al diagnòstic precoç. En la part experimental s’analitzaren tretze biòpsies gàstriques d’antre i/o cos procedents de pacients amb simptomatologies gàstriques diverses prèvies. Després de l’extracció del DNA, s’amplifica el gen 16S rRNA, es verifica per electroforesi i se seqüencia amb l’equip d’Illumina MiSeq. Posteriorment, les lectures se sotmeten a filtratge, eliminació de quimeres i agrupació en unitats taxonòmiques operatives al 97 % amb el software Mothur. Paral·lelament, una qPCR dirigida al gen cpn60, calibrada amb estàndards gBlock, quantifica les còpies bacterianes de les mostres seqüenciades. Els resultats mostren una reducció significativa de la riquesa i la diversitat alfa en mostres infectades, així com una separació clara en l’anàlisi de beta diversitat; Helicobacter pylori esdevé dominant i desplaça gèneres com Streptococcus i Lactobacillus. La combinació de la seqüenciació del 16S rDNA i l’assaig de qPCR per cpn60 ofereix un retrat filogenètic i quantitatiu d’alta resolució, capaç de detectar disbiosi precoç i estratificar el risc clínic. La contribució més destacada del projecte és, precisament, la integració del marcador cpn60 en el flux de detecció del patogen, oferint un mètode alternatiu, sensible i transferible a la pràctica diagnòstica. Paraules clau: Helicobacter pylori, microbiota gàstrica, cpn60, qPCR, 16S rDNA