Carregant...
Fitxers
Tipus de document
ArticleVersió
Versió publicadaData de publicació
Llicència de publicació
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/150222
Modulation of the helical properties of DNA: next-to-nearest neighbour effects and beyond
Títol de la revista
Director/Tutor
ISSN de la revista
Títol del volum
Recurs relacionat
Resum
We used extensive molecular dynamics simulations to study the structural and dynamic properties of the central d(TpA) step in the highly polymorphic d(CpTpApG) tetranucleotide. Contrary to the assumption of the dinucleotide-model and its nearest neighbours (tetranucleotide-model), the properties of the central d(TpA) step change quite significantly dependent on the next-to-nearest (hexanucleotide) sequence context and in a few cases are modulated by even remote neighbours (beyond next-to-nearest from the central TpA). Our results highlight the existence of previously undescribed dynamical mechanisms for the transmission of structural information into the DNA and demonstrate the existence of certain sequences with special physical properties that can impact on the global DNA structure and dynamics.
Matèries
Matèries (anglès)
Citació
Citació
BALACEANU, Alexandra, BUITRAGO OSPINA, Diana camila, WALTHER, Jürgen, HOSPITAL, Adam, DANS, Pablo d., OROZCO LÓPEZ, Modesto. Modulation of the helical properties of DNA: next-to-nearest neighbour effects and beyond. _Nucleic Acids Research_. 2019. Vol. 47, núm. 9, pàgs. 4418-4430. [consulta: 23 de gener de 2026]. ISSN: 0305-1048. [Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/150222]