Carregant...
Fitxers
Tipus de document
ArticleVersió
Versió publicadaData de publicació
Llicència de publicació
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/120776
PMut. A web-based tool for the annotation of pathological variants on proteins, 2017 update
Títol de la revista
Director/Tutor
ISSN de la revista
Títol del volum
Recurs relacionat
Resum
We present here a full update of the PMut predictor, active since 2005 and with a large acceptance in the field of predicting Mendelian pathological mutations. PMut internal engine has been renewed, and converted into a fully featured standalone training and prediction engine that not only powers PMut web portal, but that can generate custom predictors with alternative training sets or validation schemas. PMut Web portal allows the user to perform pathology predictions, to access a complete repository of pre-calculated predictions, and to generate and validate new predictors. The default predictor performs with good quality scores (MCC values of 0.61 on 10-fold cross validation, and 0.42 on a blind test with SwissVar 2016 mutations). The PMut portal is freely accessible at http://mmb.irbbarcelona.org/PMut. A complete help and tutorial is available at http://mmb.irbbarcelona.org/PMut/help.
Matèries
Matèries (anglès)
Citació
Citació
LÓPEZ FERRANDO, Víctor, GAZZO, Andrea, CRUZ, Xavier de la, OROZCO LÓPEZ, Modesto, GELPÍ BUCHACA, Josep lluís. PMut. A web-based tool for the annotation of pathological variants on proteins, 2017 update. _Nucleic Acids Research_. 2017. Vol. 45, núm. W1, pàgs. W222-W228. [consulta: 21 de gener de 2026]. ISSN: 0305-1048. [Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/120776]