Carregant...
Fitxers
Tipus de document
TesiVersió
Versió publicadaData de publicació
Llicència de publicació
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/122569
Anàlisi bioinformàtica de la base genética de la susceptibilitat al càncer de mama
Títol de la revista
Autors
Director/Tutor
ISSN de la revista
Títol del volum
Recurs relacionat
Resum
[cat] En aquesta tesi, s’analitzen les dades d’un GWAS de càncer de mama més enllà de l’anàlisi estadístic. Sota la perspectiva de la biologia de sistemes, s’apliquen unes estratègies basades en conjunts de gens/proteïnes funcionalment relacionats per identificar nous gens de baixa penetrància, els processos biològics en els que participen i els mecanismes moleculars mitjançant els quals confereixen el risc així com les seves interaccions.
El càncer de mama és un exemple de malaltia complexa on participen tant factors genètics com ambientals en la seva etiologia. Entendre la base genètica del càncer de mama en profunditat podria permetre entendre millor la malaltia i desenvolupar millors eines de diagnòstic, pronòstic i/o tractament.
D’aquesta manera, s’ha determinat que podrien influir en el risc de càncer de mama variants comunes en els gens dels processos biològics Cell Communication i Cell Adhesion; així com en determinats loci de les driver kinases, particularment en els gens que codifiquen per receptors d’EPHs. A més, variants comunes en el locus EPHB1 podrien estar associades amb el risc a càncer de mama en portadors de mutacions en BRCA1 i BRCA2.
D’altra banda, s’ha determinat que les interaccions gen-gen podrien contribuir a explicar part de la missing heritability i inclourien freqüentment gens relacionats amb processos fonamentals en diferents tipus cel·lulars, com són el metabolisme i la biosíntesi de molècules. A més, les interaccions gen-gen associades al risc de càncer podrien ser predites en part mitjançant els patrons complexes de coexpressió gènica específics del tipus de càncer.
Recentment, a partir dels resultats del metanàlisi de càncer de mama més gran realitzat fins el moment, s’ha suggerit que existeixen molts més loci (potser alguns milers), la majoria amb 0,95 < ORs < 1,05 que contribueixen a la susceptibilitat. Aquests resultats donen suport a la hipòtesi del model infinitesimal per explicar la missing heritability en càncer de mama. Segons aquesta hipòtesi, centenars o milers d’al·lels comuns, amb efectes relativament molt petits, contribuirien a la susceptibilitat a la malaltia. Així, els GWAS portats a terme fins ara,
haurien detectat els al·lels amb un efecte major, la resta dels al·lels de susceptibilitat no poden ser detectats degut als estrictes llindars de significació utilitzats en aquests estudis. En aquest context, les interaccions genètiques tampoc poden ser detectades amb robustesa degut als estrictes llindars de significació requerits. Aquest fet, justifica la nostra estratègia basada en la biologia de sistemes per l’anàlisi dels resultats del GWAS en lloc de centrar-nos en els SNPs/gens individualment.
Matèries
Matèries (anglès)
Citació
Col·leccions
Citació
BONIFACI CANO, Núria. Anàlisi bioinformàtica de la base genética de la susceptibilitat al càncer de mama. [consulta: 14 de desembre de 2025]. [Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/122569]