Avui, dijous 7 de maig, el Dipòsit Digital no estarà operatiu per tasques d'actualització. Disculpeu les molèsties.
Hoy, jueves 7 de mayo, el Dipòsit Digital no estará operativo debido a tareas de actualización. Disculpen las molestias.
Today, Thursday, May 7th, the Digital Repository will be unavailable due to a system update.

Fitxers

629980.pdf (2.12 MB)

Tipus de document

Article

Versió

Versió publicada

Data de publicació

2013-11-21

Llicència de publicació

cc-by (c) Portella, Guillem et al., 2013
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/148000

Understanding the Connetion between Epigenetic DNA Methylation and Nucleosome Positioning from Computer Simulations

Títol de la revista

Autors

Director/Tutor

ISSN de la revista

Títol del volum

Recurs relacionat

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003354

Resum

Cytosine methylation is one of the most important epigenetic marks that regulate the process of gene expression. Here, we have examined the effect of epigenetic DNA methylation on nucleosomal stability using molecular dynamics simulations and elastic deformation models. We found that methylation of CpG steps destabilizes nucleosomes, especially when these are placed in sites where the DNA minor groove faces the histone core. The larger stiffness of methylated CpG steps is a crucial factor behind the decrease in nucleosome stability. Methylation changes the positioning and phasing of the nucleosomal DNA, altering the accessibility of DNA to regulatory proteins, and accordingly gene functionality. Our theoretical calculations highlight a simple physical-based explanation on the foundations of epigenetic signaling.

Matèries

ADN, Proteïnes, Cèl·lules eucariotes

Matèries (anglès)

DNA, Proteins, Eukaryotic cells

Citació

Col·leccions

Articles publicats en revistes (Bioquímica i Biomedicina Molecular)
Articles publicats en revistes (Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona))

Citació

PORTELLA, Guillem, BATTISTINI, Federica i OROZCO LÓPEZ, Modesto. Understanding the Connetion between Epigenetic DNA Methylation and Nucleosome Positioning from Computer Simulations. PLoS Computational Biology. 2013. Vol. 9, núm. 11, pàgs. e1003354. ISSN 1553-734X. [consulta: 8 de maig de 2026]. Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/148000

Exportar metadades

JSON - METS

Compartir registre