Miniatura

Fitxers

842424.pdf (3.19 MB)

Tipus de document

Article

Versió

Versió publicada

Data de publicació

2023-10-12

Llicència de publicació

cc-by (c) Garrido Martín, D. et al., 2023
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/218925

A fast non-parametric test of association for multiple traits

Títol de la revista

Autors

Director/Tutor

ISSN de la revista

Títol del volum

Recurs relacionat

https://doi.org/10.1186/s13059-023-03076-8

Resum

The increasing availability of multidimensional phenotypic data in large cohorts of genotyped individuals requires efficient methods to identify genetic effects on multiple traits. Permutational multivariate analysis of variance (PERMANOVA) offers a powerful non-parametric approach. However, it relies on permutations to assess significance, which hinders the analysis of large datasets. Here, we derive the limiting null distribution of the PERMANOVA test statistic, providing a framework for the fast computation of asymptotic p values. Our asymptotic test presents controlled type I error and high power, often outperforming parametric approaches. We illustrate its applicability in the context of QTL mapping and GWAS.

Matèries

Anàlisi multivariable, Fenotip

Matèries (anglès)

Multivariate analysis, Phenotype

Citació

Col·leccions

Articles publicats en revistes (Genètica, Microbiologia i Estadística)

Citació

GARRIDO MARTÍN, Diego, CALVO, Miquel (calvo llorca), REVERTER COMES, Ferran, GUIGÓ SERRA, Roderic. A fast non-parametric test of association for multiple traits. _Genome Biology_. 2023. Vol. 24, núm. 1-32. [consulta: 23 de gener de 2026]. ISSN: 1474-7596. [Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/218925]

Exportar metadades

JSON - METS

Compartir registre