Carregant...
Fitxers
Tipus de document
ArticleVersió
Versió acceptadaData de publicació
Tots els drets reservats
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/121068
Parmbsc1: A refined force-field for DNA simulations
Títol de la revista
Director/Tutor
ISSN de la revista
Títol del volum
Recurs relacionat
Resum
We present parmbsc1, a force field for DNA atomistic simulation, which has been parameterized from high-level quantum mechanical data and tested for nearly 100 systems (representing a total simulation time of ∼140 μs) covering most of DNA structural space. Parmbsc1 provides high-quality results in diverse systems. Parameters and trajectories are available at http://mmb.irbbarcelona.org/ParmBSC1/.
Matèries (anglès)
Citació
Citació
IVANI, Ivan, DANS, Pablo d., NOY FREIXA, Agnès, PÉREZ, Alberto, FAUSTINO PLÓ, Ignacio, HOSPITAL GASCH, Adam, WALTHER, Jürgen, ANDRIO, Pau, GOÑI MACIÀ, Josep ramon, BALACEANU, Alexandra, PORTELLA, Guillem, BATTISTINI, Federica, GELPÍ BUCHACA, Josep lluís, GONZÁLEZ, Carlos, VENDRUSCOLO, Michele, LAUGHTON, Charles a., HARRIS, Sarah a., CASE, David a., OROZCO LÓPEZ, Modesto. Parmbsc1: A refined force-field for DNA simulations. _Nature Methods_. 2016. Vol. 13, núm. 55-58. [consulta: 14 de gener de 2026]. ISSN: 1548-7091. [Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/121068]