Amb motiu del tancament d'estiu, la validació de documents es reprendrà a partir del 28 d'agost de 2026. Disculpeu les molèsties.
Con motivo del cierre de verano, la validación de documentos se reanudará a partir del 28 de agosto de 2026. Disculpad las molestias
Due to the summer closure, document validation will resume starting August 28, 2026. We apologize for any inconvenience.

Fitxers

655215.pdf (3.9 MB)

Tipus de document

Article

Versió

Versió acceptada

Data de publicació

2016-01

Tots els drets reservats

Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/121068

Parmbsc1: A refined force-field for DNA simulations

Títol de la revista

Autors

Director/Tutor

ISSN de la revista

Títol del volum

Recurs relacionat

https://doi.org/10.1038/nmeth.3658

Resum

We present parmbsc1, a force field for DNA atomistic simulation, which has been parameterized from high-level quantum mechanical data and tested for nearly 100 systems (representing a total simulation time of ∼140 μs) covering most of DNA structural space. Parmbsc1 provides high-quality results in diverse systems. Parameters and trajectories are available at http://mmb.irbbarcelona.org/ParmBSC1/.

Matèries

Biofísica, ADN

Matèries (anglès)

Biophysics, DNA

Citació

Col·leccions

Articles publicats en revistes (Bioquímica i Biomedicina Molecular)
Articles publicats en revistes (Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona))

Citació

IVANI, Ivan, et al. Parmbsc1: A refined force-field for DNA simulations. Nature Methods. 2016. Vol. 13, num. 55-58. ISSN 1548-7091. [consulted: 14 of August of 2026]. Available at: https://hdl.handle.net/2445/121068

Exportar metadades

JSON - METS

Compartir registre