Fitxers

655215.pdf (3.9 MB)

Tipus de document

Article

Versió

Versió acceptada

Data de publicació

2016-01

Tots els drets reservats

Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/121068

Parmbsc1: A refined force-field for DNA simulations

Títol de la revista

Autors

Director/Tutor

ISSN de la revista

Títol del volum

Recurs relacionat

https://doi.org/10.1038/nmeth.3658

Resum

We present parmbsc1, a force field for DNA atomistic simulation, which has been parameterized from high-level quantum mechanical data and tested for nearly 100 systems (representing a total simulation time of ∼140 μs) covering most of DNA structural space. Parmbsc1 provides high-quality results in diverse systems. Parameters and trajectories are available at http://mmb.irbbarcelona.org/ParmBSC1/.

Matèries

Biofísica, ADN

Matèries (anglès)

Biophysics, DNA

Citació

Col·leccions

Articles publicats en revistes (Bioquímica i Biomedicina Molecular)
Articles publicats en revistes (Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona))

Citació

IVANI, Ivan, et al. Parmbsc1: A refined force-field for DNA simulations. Nature Methods. 2016. Vol. 13, num. 55-58. ISSN 1548-7091. [consulted: 21 of May of 2026]. Available at: https://hdl.handle.net/2445/121068

Exportar metadades

JSON - METS

Compartir registre