Miniatura

Fitxers

BURILLO GARCIA MARC.pdf (1.32 MB)

Tipus de document

Treball de fi de grau

Data de publicació

2024-01

Llicència de publicació

cc-by-nc-nd (c) Burillo, 2024
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/215088

Coarse-grained modelling applied to RNA morphologies and flexibility

Títol de la revista

Autors

Director/Tutor

ISSN de la revista

Títol del volum

Recurs relacionat

Resum

Traditional methods in Molecular Dynamics are encountering their computational boundaries to simulate long-time periods and large macromolecules, such as RNA. We develop an alternative approach by using: i) an ultra-simplified coarse-grained (CG) representation of the molecule and ii) a flexible non-linear potential intended to represent the accessible conformational space of RNA. This model can reproduce the flexibility observed in force-field simulations and different morphologies can be modelled. These results underscore the necessity of non-linear dynamics and statistical physics in CG to capture the dynamic behaviour of Hydrogen Bonds in RNA.

Descripció

Treballs Finals de Grau de Física, Facultat de Física, Universitat de Barcelona, Curs: 2024, Tutors: Ignacio Pagonabarraga Mora, Modesto Orozco López

Matèries

RNA, Dinàmica molecular, Treballs de fi de grau

Matèries (anglès)

RNA, Molecular dynamics, Bachelor's theses

Citació

Col·leccions

Treballs Finals de Grau (TFG) - Física

Citació

BURILLO GARCIA, Marc. Coarse-grained modelling applied to RNA morphologies and flexibility. [consulta: 24 de gener de 2026]. [Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/215088]

Exportar metadades

JSON - METS

Compartir registre