Miniatura

Fitxers

669574.pdf (3.01 MB)

Tipus de document

Article

Versió

Versió publicada

Data de publicació

2017-03-01

Llicència de publicació

cc-by (c) Guillaumet-Adkins, Amy et al., 2017
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/112225

Single-cell transcriptome conservation in cryopreserved cells and tissues

Títol de la revista

Autors

Director/Tutor

ISSN de la revista

Títol del volum

Recurs relacionat

https://doi.org/10.1186/s13059-017-1171-9

Resum

A variety of single-cell RNA preparation procedures have been described. So far, protocols require fresh material, which hinders complex study designs. We describe a sample preservation method that maintains transcripts in viable single cells, allowing one to disconnect time and place of sampling from subsequent processing steps. We sequence single-cell transcriptomes from >1000 fresh and cryopreserved cells using 3'-end and full-length RNA preparation methods. Our results confirm that the conservation process did not alter transcriptional profiles. This substantially broadens the scope of applications in single-cell transcriptomics and could lead to a paradigm shift in future study designs.

Matèries

RNA, Crioconservació d'òrgans, Criobiologia, Transcripció genètica, Genòmica, Cèl·lules

Matèries (anglès)

RNA, Cryopreservation of organs, Cryobiology, Genetic transcription, Genomics, Cells

Citació

Col·leccions

Articles publicats en revistes (Patologia i Terapèutica Experimental)
Articles publicats en revistes (Institut d'lnvestigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL))

Citació

GUILLAUMET ADKINS, Amy, RODRÍGUEZ ESTEBAN, Gustavo, MEREU, Elisabetta, MÉNDEZ LAGO, María, JAITIN, Diego a., VILLANUEVA GARATACHEA, Alberto, VIDAL-BEL, August, MARTÍNEZ MARTÍ, Alex, FELIP, Enriqueta, VIVANCOS, Ana, KEREN-SHAUL, Hadas, HEATH, Simon c., GUT, Marta, AMIT, Ido, GUT, Ivo g., HEYN, Holger. Single-cell transcriptome conservation in cryopreserved cells and tissues. _Genome Biology_. 2017. Vol. 18, núm. 45. [consulta: 14 de gener de 2026]. ISSN: 1474-7596. [Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/112225]

Exportar metadades

JSON - METS

Compartir registre