Miniatura

Fitxers

644325.pdf (210.89 KB)

Tipus de document

Article

Versió

Versió publicada

Data de publicació

2014-03-17

Llicència de publicació

cc-by-nc (c) , 2014
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/107941

An R package to analyse LC/MS metabolomic data: MAIT (Metabolite Automatic Identification Toolkit)

Títol de la revista

Autors

Director/Tutor

ISSN de la revista

Títol del volum

Recurs relacionat

https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu136

Resum

Current tools for liquid chromatography and mass spectrometry for metabolomic data cover a limited number of processing steps, whereas online tools are hard to use in a programmable fashion. This article introduces the Metabolite Automatic Identification Toolkit (MAIT) package, which makes it possible for users to perform metabolomic end-to-end liquid chromatography and mass spectrometry data analysis. MAIT is focused on improving the peak annotation stage and provides essential tools to validate statistical analysis results. MAIT generates output files with the statistical results, peak annotation and metabolite identification. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: http://b2slab.upc.edu/software-and-downloads/metabolite-automatic-identification-toolkit/.

Matèries

Cromatografia de líquids d'alta resolució, Espectrometria de masses, Metabòlits

Matèries (anglès)

High performance liquid chromatography, Mass spectrometry, Metabolites

Citació

Col·leccions

Articles publicats en revistes (Nutrició, Ciències de l'Alimentació i Gastronomia)

Citació

FERNÁNDEZ ALBERT, Francesc, LLORACH, Rafael, ANDRÉS LACUEVA, Ma. cristina, PERERA LLUNA, Alexandre. An R package to analyse LC/MS metabolomic data: MAIT (Metabolite Automatic Identification Toolkit). _Bioinformatics_. 2014. Vol. 30, núm. 13, pàgs. 1937-1938. [consulta: 21 de gener de 2026]. ISSN: 1367-4803. [Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/107941]

Exportar metadades

JSON - METS

Compartir registre