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cc by-nc (c) Díez Obrero, Virginia, 2024
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/206320

Molecular epidemiology study on genetically regulated gene expression in the colonic mucosa and its role in disease susceptibility

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Resum

[spa] La expresión genética es un proceso celular clave, que además está relacionado con la susceptibilidad genética a enfermedades y rasgos complejos. La mayoría de genes se someten a splicing alternativo (AS). Las variantes genéticas que regulan la expresión genética y el AS se llaman ¿quantitative trait loci¿ (e/sQTLs). Técnicas estadísticas permiten predecir in silico la expresión genética en un tejido concreto a partir de datos genéticos. Esta aproximación se lleva a cabo en los estudios de asociación de transcriptoma completo (TWAS). Esta Tesis se compone de tres objetivos principales y presenta tres artículos. 1) Generar perfiles de expresión genética de la mucosa colónica de individuos sanos, así como sus diferencias a lo largo del colon y sus e/sQTLs asociados; 2) Desarrollar una aplicación web que permita explorar los datos de expresión genética en el colon; 3) Llevar a cabo un TWAS para proponer genes de susceptibilidad a enfermedad inflamatoria intestinal (EII). Como resumen de los resultados, 1) se generaron catálogos de e/sQTLs a partir de nuevos datos de expresión genética en colon de 445 individuos, y se encontraron más de 4,000 genes que varían sus niveles de expresión a lo largo del colon; 2) se desarrolló el "Colon Transcriptome Explorer", disponible públicamente en https://barcuvaseq.org/cotrex/; 3) se propusieron más de doscientos genes de susceptibilidad genética a EII. En conclusión, nuestros estudios proporcionan nuevos datos y evidencias sobre los genes involucrados en mecanismos de susceptibilidad a enfermedades relacionadas con el colon, y servirán de guía a otros investigadores para proponer nuevas hipótesis en este campo.

Citació

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DÍEZ OBRERO, Virginia. Molecular epidemiology study on genetically regulated gene expression in the colonic mucosa and its role in disease susceptibility. [consulta: 21 de gener de 2026]. [Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/206320]

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