Epidemiological dynamics of Tuberculosis within the prison population and the community

Abstract

[eng] INTRODUCTION: The control of tuberculosis (TB) in Central America and South America has significantly progressed over the past 20 years. However, it has particularly stagnated during the second decade of the 21st century. Despite national and regional efforts, the stagnation of indicators has revealed a common pattern in some countries across the Latin American region. This pattern has been characterized by the concentration of the epidemic within prisons, coupled with a rising trend in incarceration rates across several countries in the region(1). Despite the decline and subsequent rebound during and after the COVID-19 pandemic, as observed in several countries, Paraguay has maintained a stable TB incidence rate over the past 15 years (2). This rate typically ranges between 38 and 45 cases per 100,000 inhabitants, which translates to approximately 3,100 cases per year. During this period, healthcare institutions have made efforts to expand and universally provide free access to diagnostic, laboratory, and radiological services, as well as treatment, extending these services to the primary level of care(3). Over the past decade, although the total number of cases in the country appears to be stable, there has been a concentration of the epidemic within the prison population. It was seen that the proportion of cases in prisons rise from approximately 7% of the total cases in 2009 to over 15% in 2018, and in recent reports, exceeding 20% of the total cases in the country (4). This concentration coincides with a doubling of the prison population, leading to overcrowding and exacerbating the TB concern. This situation may be contributing to the spread of TB to the rest of the population, undermining progress in TB control within the broader community. HYPOTHESIS: Thorough analysis of records from the National TB Program (NTP) and the Ministry of Justice, including the utilization of complete genomic sequencing of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) for cases occurring in prisons and surrounding communities, will provide us with a more precise understanding of the disease burden attributable to prisons and transmission patterns between these facilities and the broader community. MAIN OBJECTIVE The aim of this study is to describe and characterize the transmission dynamics of Mtb in penitentiary centres and the broader community in Paraguay, South America.

[spa] INTRODUCCIÓN: El control de la tuberculosis (TB) en Centroamérica y Sudamérica ha avanzado de manera considerable desde finales de los 90 y durante los últimos 20 años. Pero particularmente durante la segunda década del siglo XXI se ha estancado. Este estancamiento de los indicadores, a pesar de los esfuerzos nacionales y regionales, ha expuesto un patrón común en algunos países de la región latinoamericana. El patrón común ha sido la concentración de la epidemia en las prisiones, acompañado de un proceso de aumento de los niveles de tasas de encarcelamientos en varios países de la región(1). A pesar del descenso y el repunte posterior durante y después de la Pandemia por COVID-19, como ocurrió en varios países, Paraguay es un país que tiene una tasa de incidencia de TB estable durante los últimos 15 años, que ronda entre 38 y 45 casos por 100.000 habitantes, lo que equivale a una media de 3100 casos por año(2). Durante este periodo desde las instituciones de salud se ha hecho el esfuerzo de expandir y universalizar gratuitamente el acceso al diagnóstico, laboratorial y radiológico, y al tratamiento, llegando hasta primer nivel de atención(3). Durante la última década, aunque la cantidad de casos totales en el país pareciera ser estable, ocurrió una concentración de la epidemia en la población penal, pasando de valores de cercanos al 7% del total de casos en prisiones en el 2009 a superiores al 15% en el 2018, y en últimos informes por encima del 20% del total de casos del país(4). Esta concentración ocurre en un proceso también de duplicación de la población penal, generando hacinamiento y potenciando el problema de la TB, el cual puede estar condicionando un derrame de este problema al resto de la población, torpedeando los avances del control de la enfermedad en el resto de la comunidad. La urgencia de focalizar estrategias para interrumpir la transmisión y prevenir nuevas infecciones dentro y fuera de los centros penales es fundamental. Sin embargo, aún se desconoce la dimensión que juegan las instituciones penitenciarias a sus poblaciones aledañas en la transmisión. En tal sentido, esta tesis tiene el objetivo de describir el riesgo para desarrollar TB en prisión, sus factores asociados, cómo persiste este riesgo una vez que se sale de prisión, además de detallar filogenéticamente cómo se generan clústeres comunes entre la prisión y la comunidad.

HIPÓTESIS:

Un análisis profundo de los registros del Programa Nacional de Tuberculosis (PNT) y del Ministerio de Justicia, incluyendo la secuenciación genómica completa de Mycobacterium tuberculosis (Mtb) para casos ocurridos en prisiones y comunidades circundantes, nos proporcionará una comprensión más precisa de la carga de enfermedad atribuible a las prisiones y los patrones de transmisión entre prisiones y comunidad en general. OBJETIVO:

El objetivo principal de esta tesis es caracterizar las dinámicas de transmisión del Mtb entre los centros penitenciarios y el resto de la comunidad en Paraguay, Sudamérica.