Carregant...
Fitxers
Tipus de document
ArticleVersió
Versió publicadaData de publicació
Llicència de publicació
Si us plau utilitzeu sempre aquest identificador per citar o enllaçar aquest document: https://hdl.handle.net/2445/224957
Variability vs. phenotype: Multimodal analysis of Dravet syndrome brain organoids powered by deep learning
Títol de la revista
Director/Tutor
ISSN de la revista
Títol del volum
Recurs relacionat
Resum
Dravet syndrome (DS) is a developmental epileptic encephalopathy (DEE) driven by pathogenic variants in the SCN1A gene. Brain organoids (BOs) have emerged as reliable models for neurodevelopmental genetic disorders, reproducing human brain developmental milestones and rising as a promising drug testing tool. Here, we determined the underlying molecular DS pathophysiology affecting neuronal connectivity, revealing an early onset excitatory-inhibitory imbalance in maturing DS organoid circuitry. However, neuronal circuitry modeling in BOs remains hampered by the notorious inter- and intra-organoid variability. Thus, leveraging deep learning (DL), we developed ImPheNet, a predictive tool grounded in BO live imaging datasets, to overcome the limitations of the intrinsic BOs variability. ImPheNet accurately classified healthy and DS phenotypes at early onset stages, revealing differences between genotypes and upon antiseizure drug exposure. Altogether, our DL-predictive live imaging strategy, ImPheNet, emerges as a powerful tool to accelerate DEEs research and advance toward treatment discovery in a time- and cost-efficient manner.
Matèries
Matèries (anglès)
Citació
Col·leccions
Articles publicats en revistes (Patologia i Terapèutica Experimental)
Articles publicats en revistes (Biomedicina)
Articles publicats en revistes (Física de la Matèria Condensada)
Articles publicats en revistes (IDIBAPS: Institut d'investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Articles publicats en revistes (Institut d'lnvestigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL))
Articles publicats en revistes (Biomedicina)
Articles publicats en revistes (Física de la Matèria Condensada)
Articles publicats en revistes (IDIBAPS: Institut d'investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Articles publicats en revistes (Institut d'lnvestigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL))
Citació
LAO, Oscar, ACOSTA, Sandra, TURPIN, Isabel, MODREGO, Adriana, MARTÍ SARRIAS, Andrea, ORTEGA GASCÓ, Alba, HAEB, Anna-christina, GARCÍA GONZÁLEZ, Laura, SORIANO I FRADERA, Jordi, RUIZ, Núria, PEÑUELAS HARO, Irene, ESPINET, Elisa, TORNERO, Daniel. Variability vs. phenotype: Multimodal analysis of Dravet syndrome brain organoids powered by deep learning. _iScience_. 2025. Vol. 28, núm. 11. [consulta: 10 de gener de 2026]. ISSN: 2589-0042. [Disponible a: https://hdl.handle.net/2445/224957]